Op wetenschappelijk gebied staat methyleenblauw bekend als methylthioninechloride, het is een kleurstof die wordt gebruikt als kleurstof om sommige delen van het lichaam van een persoon te pigmenteren, voor of tijdens een operatie. Artsen gebruiken het in feite als een antiseptische en interne cauterizer.
Het wordt ook gebruikt als verf in vlekken voor waarnemingen door een microscoop, en om de resultaten in laboratoria te schilderen, omdat het de mogelijkheid heeft om urine en ontlasting te kleuren. Ten slotte wordt het ook gebruikt bij de behandeling om methemoglobine te verminderen. Een van de kenmerken is dat het een element bestaat uit kristallen van een heldere donker groene kleur, het heeft geen geur en is niet veranderd door de lucht.
Het kan gemakkelijk worden opgelost in water en voorzichtig in alcohol en wanneer het ermee in contact komt, verandert de kleur in diep donkerblauw, het wordt ook gebruikt om nagelschimmel te bestrijden, het kan ook worden gebruikt om witte kleding te schilderen, als dat zo is begint gelig te worden.
In de aquacultuur wordt het veel gebruikt om infecties bij tropische vissen te behandelen, het is zeer effectief in het bestrijden van de protozoaire parasiet, die infecties bij vissen veroorzaakt. Het wordt in feite gebruikt om de eieren te verzorgen die onlangs door de vissen zijn gelegd, zodat ze niet besmet raken door bacteriën of schimmels, het is erg handig als u de eieren kunstmatig wilt uitbroeden. Mensen kunnen methyleenblauw kopen zonder recept, het wordt over het algemeen gebruikt als een actueel antisepticum.
