Hydrogensomen zijn de vreemdste eukaryote organellen met de hoogste groei ter wereld. Dit organel bevindt zich in het cytoplasma, het is samengesteld uit een dubbel weefsel, waar het binnenmembraan een kam geeft. Hydrogensomen zijn geëvolueerd uit mitochondriën door het weglekken van elementaire mitochondriale kenmerken, zoals het verlies van hun genoom.
De grootte van deze organellen is ongeveer één diameter. De belangrijkste functie is om in te grijpen in het proces van fermentatie metabolisme van sommige wezens gekozen om verwerven ATP (energie molecuul) in geval van gebrek aan zuurstof. Opgemerkt moet worden dat deze functie vergelijkbaar is met de mitochondriale ademhaling die wordt uitgevoerd door anaërobe micro-organismen. Daarin worden pyrodruivenzuren afgebroken, de essentiële moleculen binnen het metabolisme, het bevindt zich precies in het midden van de paden voor het verkrijgen van energie van elk levend wezen. De afbraak van pyrodruivenzuren is een proces dat wordt uitgevoerd door het hydrogenoom dat CO2 absorbeert, acetaat dat wordt uitgestoten in het celcytoplasma.
Nu zou het hierboven beschreven proces de evolutie van mitochondriën kunnen beschrijven, maar dit moet zeer zorgvuldig worden ontdekt, aangezien het niet precies bekend is of mitochondriën en hydrogensomen organellen zijn die samen zijn geëvolueerd. Concreet zou het nodig zijn om te onderzoeken of waterstofsomen elektronentransportketens hebben. Dit is uitermate belangrijk omdat het waterstoftransport wordt aangetast tijdens het ademhalingsproces. Als beide organellen vergelijkbare eiwitten gebruiken, kan worden afgeleid dat ze met elkaar verbonden zijn en door deze eiwitten te contrasteren met vergelijkbare bacteriële eiwitten, zal het mogelijk zijn om echt te weten of de waterstofsomen zijn afgeleid van de mitochondriën of, integendeel, ze hebben een onafhankelijke oorsprong.
Ten slotte moet hieraan worden toegevoegd dat de ontdekking van deze organellen in de jaren 70 werd gedaan.